Industri yang beroperasi di Kota Bogor tahun 2003 sebanyak 2.722 unit dengan penyerapan tenaga kerja 43.612 orang dan nilai investasi sebesar  Rp. 357.216.795.046,00. Dengan rincian 2.722 Unit Usaha industri yang ada, terdiri dari industri Menengah/Besar sebanyak 56 Unit dengan penyerapan tenaga kerja  23.870 orang dan investasi sebesar Rp. 328.014.725.889,00 Industri Kecil Formal sebanyak 728 unit dengan unit penyerapan tenaga kerja sebanyak 11.192 orang dan investasi  Rp. 26.326.518.987,00 serta industri Kecil Non Formal 1.938 Unit dengan penyerapan tenaga kerja 8.550 orang dan investasi sebesar  Rp. 2.875.550.164,00.

Pengembangan kegiatan industri di Kota Bogor telah memperhatikan kaidah-kaidah lingkungan yakni dengan dikembangkannya Industri Kecil yang Non polutan dan bersifat padat karya melalui perbaikan lingkungan dan lokalisasi usaha.

Skala prioritas pengembangan jenis industri yang ramah lingkungan melalui pengembangan agroindustri yang dikaitkan dan diintegrasikan dengan sistem agribisnis dengan tujuan meningkatkan nilai tambah dan memperkuat struktur industri, meningkatkan ekspor hasil industri, memperluas kesempatan kerja dan usaha, serta mendukung usaha pengentasan kemiskinan. Hal ini dapat terlihat dengan diwajibkannya pada industri untuk menyediakan SPAL (Saluran Pengembangan Air Limbah), IPAL, Pengelolaan sampah serta saluran drainase.